После того, как Годзилла вышел победителем после схватки с Кингом Гидорой и, таким образом, заявил о своем праве быть истинным Королем, а Конг встретился с группой людей на Острове черепа, организация «Монарх» продолжила свои исследования. Но все знали, что этот день однажды настанет, когда столкнутся два величайших титана на Земле. И вот это случается: теперь микадо будет биться с Конгом, и мир наконец узнает, кто же из них сильнее. Но, несмотря на огромный масштаб этого события, встреча двух монстров может нести негативные и весьма разрушительные последствия для человечества. Вскоре выяснится, что от исхода этого невероятного противостояния будет зависеть слишком многое....